在上小学之前，郑亚旗曾上过几天的幼儿园。有一天，从幼儿(幼儿食品)园回来，郑渊洁发现郑亚旗情绪有些低落，一问才知道老师不让说话的时候他说话了，被独自关进小黑屋子里几个小时。郑渊洁愤怒了：幼儿园时期的孩子正是心灵成长的关键期，这会给孩子的心灵造成多大的伤害？！他把郑亚旗接回家，再没踏进幼儿园一步。“现在郑亚旗还非常怕黑，这都是幼年的影响。”郑渊洁说。
郑亚旗不爱回忆短暂的学校时光，因为那是一段“不愉快的记忆”，“其实老师倒没对我怎么着，就是好多地方和郑渊洁的教育不一样。”
从小郑渊洁就教育郑亚旗：人活着要有尊严，要懂得爱和自由。从上学的那天起，他就告诉郑亚旗：分数是这个世界上最不重要的东西。
郑亚旗回来讲，一个同学迟到了，老师当着全班同学的面把文具盒扔在地上说：“你以后吃屎都接不到热乎的。”
幼小的郑亚旗问郑渊洁：“郑渊洁，你说老师做得对吗？”
“当然不对。”
“不对你去学校和校长说。”
“我不敢。”郑渊洁语塞了。郑亚旗就读的是一所重点小学，班主任老师是优秀班主任，为了高分数，年年期末考试漏题给学生。
郑亚旗问：郑渊洁，你说老师漏题对吗？“不对，那是作弊。”“不对，你告诉校长去。”“我不敢。”“我是真不敢，我的孩子还在学校呢，那就是在人家手里的人质，就像自己的亲骨肉在‘绑匪’手里呢，借我10个胆子也不敢。我是很窝囊的人，老师会让全班同学孤立你，孩子就毁了。”郑渊洁说。
“我不是完全反对现行教育体制，但是学校教育不太重视心灵教育这一块，而这是我最看重的。”
转眼到了郑亚旗小学毕业考试，他拿回家中一套试题，是区里的统考题，又是班主任老师漏给学生的。
郑渊洁和郑亚旗联手干了一件解气的事儿，他们分析哪道题大概多少分，分析完了故意考了一个62分，拖全班的平均分。
考完试第二天，郑渊洁征求郑亚旗意见：咱退学。小学毕业典礼都没参加。退学前，他们干的最后一件事儿是，郑亚旗拉出了一个自己班级的差生名单，郑渊洁一人送了一本自己写的书，书的扉页上写着：你是最棒的。
暑期中，郑渊洁咨询了很多朋友，把孩子留在家中教育行不行。大家或反对或不置可否，连郑渊洁的好友、央视主持人崔永元都说，不成。现在是群体化社会了，关在家里，容易让孩子性格孤僻，不合群。
犹豫中，郑渊洁还是给郑亚旗报了初中。等到开学测试时，他透过窗玻璃往里看，主考官们正在训斥孩子：“你怎么这么笨？”“你智商是不是有问题？”
郑渊洁拉着郑亚旗就回家了。
郑亚旗和父亲的私塾生活
一个房间布置成了教室，有黑板，有讲台，有课桌，一切都和学校的布置一样，还在暖气片上绑上了一面国旗，每周一举行升旗仪式。 退学后，郑渊洁拿出了一个房间，布置成了教室，有黑板，有讲台，有课桌，一切都和学校的布置一样，还在暖气片上绑上了一面国旗，每周一举行升旗仪式。教材采用的是郑渊洁自己编撰的《郑家菜》，这是10部以标准教材为参考，郑渊洁的童话主人公皮皮鲁、鲁西西贯穿始终的概括了多种知识和方法的教材。郑渊洁在编撰这套教材前，将小学到高中的课本仔仔细细地读了两遍。在编写法制篇《皮皮鲁和419宗罪》时，不仅买了刑法参考，还买了至少七八本法律专著。郑渊洁比较看重这部法制篇，“现在的学校对孩子的法制教育挺忽视的，基本是缺失。”中国的刑法一共有419项罪名，他就把这419个罪名编成了419个童话故事。
其他还有创新和怀疑篇《脚踏实地目空一切的贝塔》、哲学篇《鲁西西和苏格拉底对话录》、性知识篇《你从哪里来，我的朋友》、道德篇《罗克为什么不是狼心狗肺》、安全自救篇《再送你100条命》等等，涵盖范围远远超出学校教授内容，总字数400万字。
郑渊洁的基本思路是，学校提供给孩子的只是考试能力，而在这之外，还有更重要的诸如爱的能力、生存能力、自助能力……两年的时间里，郑渊洁都要拿出下午两到三个小时来编写教材，不爱看书的他，之前总共看书不超过20本，为编写教材，一下子突击了上百本。这个过程让他异常痛苦，“如果不是为了儿子，我这辈子绝不会干这样的事儿。”
郑渊洁聘请了退休的高级教师，教授其他课程，而自己亲自操刀上阵，教授写作。
郑亚旗当时还在爱睡懒觉的年纪，所以课程都是从下午开始，一天三节，没有礼拜日。傍晚，郑渊洁会带着他到附近的刺猬河边去散步，那是另外的课堂，郑渊洁会找出来电视上或书里的某几个话题，认真地和郑亚旗讨论，聊天话题千奇百怪，奇异思想层出不穷。
3年之后，郑亚旗学完了中学六年的课程，从这所特殊的学校毕业了。
交往“黑洞”
“他的青春期和外界交往还是很多的，惟一欠缺的就是不上学，失去了早恋的机会，但你总不能这个也要那个也要，哪来的这么好的事儿啊。”
自从儿子辍学回家，郑渊洁一直将崔永元“孩子可能不合群”的话记在心上，他对于郑亚旗社交能力的信心后来来源于一次网友聚会。
那是郑亚旗第一次参加网友聚会，1995年，郑亚旗失学之前的半年。其时大家已经在网络上聊了大半年，就约定见一见，地点选在一家肯德基店。
郑渊洁问郑亚旗：“你是决定一个人坐公车去啊，还是我开车送你？”郑亚旗选择坐公车，郑渊洁还是不放心，把儿子送到了地儿。郑亚旗向他摆手：“你走吧，走吧，见网友哪有爸爸(爸爸食品)一起跟着的啊。”
“第一次见网友好玩极了，全是男的，一个女的没有。都比我大很多，除了我，小的也二十多了，大的比郑渊洁还老。我们聊的大部分是计算机内容，还商量了合伙给别人设计网站和主页，他们指着我说，等你18岁了，咱们就成立公司，你来当老板。”回忆当年的情景，郑亚旗还止不住兴奋，“好玩，真好玩，比和同龄人一起好玩多了。为什么指定我当老板？我小啊，这么小就和他们混在一起，前途无量啊。”
小学五年级后，郑亚旗迷上电脑，就和同龄人失去了交流的乐趣。“主要是我本来就不怎么爱和他们一起打闹，现在我说的他们都听不懂了，我就是喜欢和比我大的人接触，下棋总和臭棋下，会越下越糟的。”
网友成为郑亚旗的世界中与外界连通的最重要纽带，除了后来的同事和合作伙伴，他的通讯录中百分之八十都是网友的名字。“郑渊洁老怕我被骗，我就和他说，你不是把鉴人法宝都交给我了吗？和外人接触的时候，首先都往最坏了想，当你发现果真如同自己的假设，你就会对自己的判断力表示满意。当你发现对方其实很不错，你就有了一种意外收获的喜悦。基本上，所有的网友都不错，没有利害关系的时候，这个世界上哪有坏人啊？”
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